在生物医疗领域，获取符合宏基因组学研究标准的高质量环境DNA是一项极具挑战的任务。环境DNA的质量和产量受到样本类型和核酸提取方案的显著影响，尤其是在处理低生物量、难以破碎、重金属浓度较高或腐殖质含量丰富的样本时。此外，不同的环境DNA提取方案也可能引入偏差，从而影响研究对象微生物群落的组成。

为了应对这些挑战并缩短实验周期，避免数据偏差，尊龙凯时人生就博针对不同来源的水体样本和多样的研究需求，整理并推荐了相应的核酸提取方案。本期将重点分享在重金属污染土壤、沉积物等低生物量样本中的经验和技巧。

在发现重金属耐受菌及研究重金属污染的生物修复策略过程中，从重金属污染矿区土壤中有效提取DNA是基础且关键的步骤。与其他土壤生态环境相比，重金属污染土壤的pH值极端、重金属浓度高、腐殖质丰富且营养物质缺乏，这导致这些土壤样本的生物量较低并含有多种干扰DNA提取的抑制剂。直接使用常规试剂盒提取往往会面临产量低和DNA质量不佳的问题。

对这种特殊样本，适当的前处理步骤结合有效的DNA提取方案能带来意想不到的结果。中国地质大学董海良课题组提出了一种针对重金属污染土壤的高效DNA提取方法，首先使用去腐试剂（如EDTA和NaCl）对样本进行前处理，去除腐殖质和重金属，随后通过密度梯度离心分离微生物，再使用尊龙凯时人生就博的升级版DNeasyPowerSoil ProKit进行DNA提取。研究表明，经过改良的前处理流程配合该试剂盒显著提高了DNA质量，更加有利于后续的PCR实验。

DNeasyPowerSoil ProKit是尊龙凯时人生就博PowerSoil Pro系列中专为土壤微生物DNA提取而设计的产品。该系列的核心技术包括珠磨研磨和抑制剂去除，经过升级后，研磨珠的材质与粒径得到优化，能够有效非偏倚地破碎难裂解微生物，并确保高产量的核酸获取。同时，抑制剂去除技术已更新至第二代，适用于抑制剂浓度较高的样本，处理时间仅需1-2分钟，即可有效去除抑制剂，确保沉积物、污水等难样本的提取成功。

除了DNA的产量和纯度，片段完整性、微生物α多样性和结果的可重复性对于研究样本中微生物群落的组成至关重要。接下来，我们将探讨如何利用DNeasyPowerSoil ProKit提高沉积物样本的提取质量。

海洋、河流和湿地中的沉积物样本是另一类重要的环境材料，对微生物资源的研究与开发利用具有重要意义。然而，沉积物中同样含有大量腐殖酸，微生物丰度较低且易被小颗粒的粘土或矿物质干扰，因此常规DNA提取试剂盒的效果往往不佳。Demkina等人的研究比较了市场上8种微生物DNA试剂盒在沉积物、水体及海洋无脊椎动物消化道样本上的提取效果，结果发现DNeasyPowerSoil ProKit符合要求，其提取的DNA浓度较高且在储存三个月后仍保持良好的完整性。

DNeasyPowerSoil ProKit的提取流程内含专门的抑制剂去除步骤，实现了对抑制剂的有效去除，确保了下游PCR等反应的准确性。此外，对不同试剂盒在真核DNA占比、α多样性和结果可重复性方面的评估表明，DNeasyPowerSoil ProKit在多个指标上均表现优异，具有最高的α多样性和更佳的OTUs。

由于其能够获取完整性较好的微生物DNA，DNeasyPowerSoil ProKit特别适合用于宏基因组长读长测序。浙江大学杭州国际科创中心研究团队在墨西哥加州湾深海热液口发现了新型ANME古菌属及其宿主的病毒样本，该研究使用的提取流程同样是基于尊龙凯时人生就博的DNeasyPowerSoil ProKit进行的。

整体而言，对于低生物量的微生物样本，建议进行必要的样本保存以确保后续核酸的高产量和良好完整性。PowerProtectDNA/RNA是一种专为微生物样本设计的保存液，通过渗透细胞以终止微生物活性，从而保持微生物群落和功能在运输及储存期间的原有状态。该保存液还具有在高温下维持DNA稳定和长效保存RNA的能力，使得在使用尊龙凯时人生就博的“Power”系列试剂盒提取核酸时无缝衔接。

如您希望深入了解更多关于微生物组样本的核酸提取方案，欢迎联系尊龙凯时人生就博，获取更多资源和信息。